Le déroulement
La Révolution de 1789 fut accueillie dans le Jura avec enthousiasme.
La Franche-Comté fut divisée en trois départements - Haute-Saône, Doubs et Jura, correspondant à peu de chose près aux trois anciens bailliages d'Amont (chef-lieu Vesoul), du Milieu (chef-lieu Besançon) et d'Aval (chef-lieu Lons-le-Saunier). Le pays de Montbéliard ne fut réuni à la France qu'en 1793 et rattaché au département du Doubs.
Dans le Jura les écclésiastiques accueillèrent la constitution à laquelle ils devaient prêter serment de manière très contrastée, c'est ainsi que Mr Guillot, curé d'Orchamps, refusa en 1791 sa promotion comme évêque du Jura mettant en avant son âge ou encore Mr Patenaille, curé d'Arlay, qui refusa d'accepter la constitution civile du clergé et qui sera remplacé et convié à quitter la maison curiale sous 8 jours.
Certains défendent toutefois la constitution comme Mr Jousserandot, curé de Toulouse le Château, qui n'hésite pas à faire l'apologie de la révolution.
2 prêtres jurassiens furent guillotinés.
En Juin 1793, à la suite de l'éxécution des girondins, certains départements Français entrèrent en rébellion ouvertes avec le pouvoir révolutionnaire parisien, ce fut le cas dans le Jura ou Lons Le Saunier perdit sa place de chef-lieu du département au profit de Dole.
René-François Dumas (1753 - 1794), né à Jussey et surnomé le rouge, sera président du tribunal révolutionnaire et pourvoyeur de l'échafaud parisien, sur lequel il montera le 9 Thermidor.
Condamnation à mort enregistrée
Anne OUDET, âgée de 33 ans, né à Rochefort, département du Jura, domestique chez la veuve Varin, condamnée à mort le 1 thermidor an 2, par le tribunal révolutionnaire de Paris, comme contre-révolutionnaire, ayant caché et recelé des effets appartenants à des émigrés et prêtres réfractaires..
Claude-François RENEL COPERSCHMIDT, né à Dole en 1760. Il appartenait à une bonne famille de robe, et son père était substitut au bailliage et siège présidial de Dole. M. Rénel était considéré comme prêtre réfractaire. Il fut guillotiné le 3 janvier 1794 à Dole.
François Joseph ROBERT, était né à Mont-de-Vougney en 1763. Il était vicaire de Guyans-Vennes, où il avait succédé au bon M. Huot qui avait déjà donné son sang pour la Foi. M. Robert refusa formellement de prêter le serment. Il fut guillotiné le 21 janvier 1794 .
Jean Baptiste François ATTIRET, était né à Dole en 1747 et appartenait à une famille célèbre dans le monde des arts. L'abbé Attiret eut l'honneur d'être considéré comme le chef de la Conspiration dite des Prisons, ou du Luxembourg, et sous ce prétexte il fut traduit le 10 juillet 1794 devant le tribunal révolutionnaire. Il fut condamné à mort et exécuté cette même année.
Armand Hylaire Comte de LAUBESPINS, d'une des plus ancienne familles de Franche-Comté, était né à Chilly les Messia. Le 3 juin 1794, à soixante-dix ans, il montait sur l'échafaud..
Claude Joseph MARTIN, né à Moirans, dicoèse de Saint-Claude, le 17 novembre 1728. M. Martin refusa le serment mais il ne voulut point abandonner sa paroisse et il s'y maintint caché exerçant le ministère apostolique. Il fut exécuté le 4 février 1794 à Lyon..
Jean MERMET, né à Désertin alors paroisse de Choux, et aujourd'hui paroisse des Bouchoux, au diocèse de Saint-Claude, le 16 mars 1745. Prêtre en 1768, il fut condamné à mort le 14 septembre 1797.
Gaspard François PIDOUX, Né à Orgelet le 11 décembre 1783, il fut baptisé le même jour. Il fut exécuté à Lyon.